Lyon : Ce que l’on sait sur le virus Shamonda, un virus animal détecté pour la première fois chez l’être humain

C’est une première mondiale. Dans un communiqué transmis mercredi, les services de l’Etat ont annoncé la détection chez l’être humain du virus Shamonda, connu uniquement - jusqu’ici - chez les animaux. 20 Minutes fait le point.

C’est quoi le virus Shamonda ?

Le Shamonda est un orthobunyavirus transmis aux animaux par des moucherons piqueurs. Détecté pour la première fois au Nigeria au milieu des années 1960, il a été signalé de façon sporadique chez les bovins en Afrique de l’Ouest, de l’Est et australe, ainsi qu’au Japon. À l’été 2026, il a été identifié pour la première fois en Europe, y compris en France, dans des exploitations bovines. « Les bovins sont considérés comme les hôtes principaux, écrit la préfecture de l’Ain. Des cas sporadiques ont aussi été relevés cet été en France chez des petits ruminants et des équidés. »

Comment a-t-il contaminé un être humain ?

Malgré plusieurs décennies de circulation en Afrique et en Asie, aucun cas humain n’avait été documenté. Le virus Shamonda était jusqu‘à présent considéré comme non transmissible à l’être humain. « L’infection par le virus Shamonda chez ce patient constitue ainsi la première détection documentée et rapportée du virus chez l’être humain », rappelle la préfecture.

L’hypothèse privilégiée est celle d’une contamination par piqûre d’un moucheron du genre Culicoïdes, dans l’Est de la France, où une circulation du virus chez l’animal a été rapportée au printemps et à l’été 2026.

Que s’est-il passé pour le patient touché ?

Dans leur communiqué, les autorités sanitaires précisent que ce virus a été détecté chez un patient sévèrement immunodéprimé, pris en charge aux Hospices civils de Lyon (HCL) pour une pathologie grave. Il est décédé début octobre.

Selon les premiers éléments de l’enquête, les complications cérébrales observées chez le patient avant son décès seraient très probablement liées à l’infection par ce virus. Il s’agit, soulignent les autorités, d’un cas exceptionnel, survenu chez une personne fortement immunodéprimée.

Des investigations cliniques, biologiques et épidémiologiques sont toujours en cours, dans une approche « Une seule santé » qui associe des experts de la santé humaine, animale et environnementale. Au vu des connaissances disponibles, les autorités indiquent qu’« aucun risque sanitaire pour la population générale n’est identifié à ce jour ».

« Les autorités sanitaires françaises ont notifié l’Organisation mondiale de la santé (OMS) et le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) », conclut le communiqué.